Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6685D3YYP3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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