Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Rnf217D3YYI7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf217D3YYI7 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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