Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Rfx8D3YU81 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Rfx8D3YU81 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Rfx8D3YU81 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Rfx8D3YU81 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Rfx8D3YU81 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Rfx8D3YU81 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Rfx8D3YU81 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Rfx8D3YU81 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Rfx8D3YU81 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Rfx8D3YU81 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Rfx8D3YU81 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Rfx8D3YU81 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rfx8D3YU81 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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