Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Usf3B2RUQ2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Usf3B2RUQ2 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Usf3B2RUQ2 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usf3B2RUQ2 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms