Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rrn3B2RS91 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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