Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms