Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Trabd2bB1ATG9 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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