Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Grik3B1AS29 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms