Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms