Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Prr16A3KMN5 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Prr16A3KMN5 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Prr16A3KMN5 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr16A3KMN5 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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