Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GabreA2AMW3 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms