Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frmpd1A2AKB4 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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