Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Lcn6A2AJB9 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Lcn6A2AJB9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Lcn6A2AJB9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Lcn6A2AJB9 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Lcn6A2AJB9 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Lcn6A2AJB9 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Lcn6A2AJB9 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Lcn6A2AJB9 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Lcn6A2AJB9 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lcn6A2AJB9 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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