Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms