Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc163A2AGD7 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms