Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Gm5538W4VSP6 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Gm5538W4VSP6 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Gm5538W4VSP6 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Gm5538W4VSP6 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Gm5538W4VSP6 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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Gm5538W4VSP6 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Gm5538W4VSP6 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Gm5538W4VSP6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Gm5538W4VSP6 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Gm5538W4VSP6 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5538W4VSP6 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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