Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.6 ms