Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Hdac6Q9Z2V5 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Hdac6Q9Z2V5 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Hdac6Q9Z2V5 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Hdac6Q9Z2V5 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Hdac6Q9Z2V5 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Hdac6Q9Z2V5 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Hdac6Q9Z2V5 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Hdac6Q9Z2V5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Hdac6Q9Z2V5 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Hdac6Q9Z2V5 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms