Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Cldn7Q9Z261 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Cldn7Q9Z261 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Cldn7Q9Z261 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Cldn7Q9Z261 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Cldn7Q9Z261 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Cldn7Q9Z261 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Cldn7Q9Z261 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Cldn7Q9Z261 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Cldn7Q9Z261 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms