Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ilf3Q9Z1X4 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms