Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl8Q9Z121 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms