Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Csnk1eQ9JMK2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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