Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc2lQ9JME7 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
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