Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sfmbt1Q9JMD1 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sfmbt1Q9JMD1 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms