Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rabgef1Q9JM13 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rabgef1Q9JM13 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rabgef1Q9JM13 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rabgef1Q9JM13 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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