Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Prg3Q9JL95 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prg3Q9JL95 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms