Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms