Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms