Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Gfra4Q9JJT2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Gfra4Q9JJT2 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Gfra4Q9JJT2 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
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Gfra4Q9JJT2 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Gfra4Q9JJT2 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms