Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lmbr1Q9JIT0 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms