Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms