Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SyncQ9EPM5 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms