Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP64

Tnmd, Tenomodulin, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnmdQ9EP64 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TnmdQ9EP64 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TnmdQ9EP64 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TnmdQ9EP64 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TnmdQ9EP64 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TnmdQ9EP64 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TnmdQ9EP64 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
TnmdQ9EP64 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TnmdQ9EP64 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TnmdQ9EP64 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TnmdQ9EP64 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TnmdQ9EP64 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TnmdQ9EP64 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TnmdQ9EP64 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TnmdQ9EP64 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TnmdQ9EP64 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TnmdQ9EP64 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TnmdQ9EP64 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TnmdQ9EP64 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TnmdQ9EP64 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TnmdQ9EP64 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TnmdQ9EP64 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TnmdQ9EP64 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TnmdQ9EP64 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TnmdQ9EP64 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TnmdQ9EP64 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TnmdQ9EP64 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TnmdQ9EP64 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TnmdQ9EP64 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TnmdQ9EP64 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TnmdQ9EP64 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TnmdQ9EP64 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TnmdQ9EP64 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TnmdQ9EP64 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TnmdQ9EP64 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TnmdQ9EP64 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TnmdQ9EP64 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TnmdQ9EP64 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TnmdQ9EP64 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TnmdQ9EP64 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TnmdQ9EP64 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TnmdQ9EP64 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TnmdQ9EP64 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms