Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smg9Q9DB90 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Smg9Q9DB90 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Smg9Q9DB90 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Smg9Q9DB90 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Smg9Q9DB90 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Smg9Q9DB90 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Smg9Q9DB90 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Smg9Q9DB90 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Smg9Q9DB90 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Smg9Q9DB90 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Smg9Q9DB90 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Smg9Q9DB90 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Smg9Q9DB90 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Smg9Q9DB90 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Smg9Q9DB90 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Smg9Q9DB90 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg9Q9DB90 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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