Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms