Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB16

Cab39l, Calcium-binding protein 39-like, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39lQ9DB16 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39lQ9DB16 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms