Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Tmem239Q9DA47 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Tmem239Q9DA47 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
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Tmem239Q9DA47 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Tmem239Q9DA47 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem239Q9DA47 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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