Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzd9Q9D9M4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms