Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9D7E4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q9D7E4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9D7E4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9D7E4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9D7E4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms