Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc7Q9D541 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms