Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stag1Q9D3E6 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms