Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt20Q9D312 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt20Q9D312 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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