Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.9 ms