Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e1Q9D0D5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms