Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Shisa9Q9CZN4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Shisa9Q9CZN4 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms