Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms