Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mis12Q9CY25 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms