Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
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