Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rpusd4Q9CWX4 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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