Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BccipQ9CWI3 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms